Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmed5Q9CXE7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmed5Q9CXE7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms