Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Xrcc3Q9CXE6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms