Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mgme1Q9CXC3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms