Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CWU4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CWU4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q9CWU4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q9CWU4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms