Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smyd3Q9CWR2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smyd3Q9CWR2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd3Q9CWR2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms