Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930553M12RikQ9CUH1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4930553M12RikQ9CUH1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930553M12RikQ9CUH1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms