Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Klhl28Q9CR40 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl28Q9CR40 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms