Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931417E11RikQ9CR05 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931417E11RikQ9CR05 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms