Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Smim8Q9CQQ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms