Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rdm1Q9CQK3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rdm1Q9CQK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rdm1Q9CQK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms