Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snrpb2Q9CQI7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snrpb2Q9CQI7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms