Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rpa3Q9CQ71 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rpa3Q9CQ71 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms