Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nudcd2Q9CQ48 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nudcd2Q9CQ48 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms