Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Bcl11bQ99PV8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Bcl11bQ99PV8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Bcl11bQ99PV8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms