Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim26Q99PN3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim26Q99PN3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim26Q99PN3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
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