Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bco2Q99NF1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Bco2Q99NF1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Bco2Q99NF1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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