Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Atoh8Q99NA2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atoh8Q99NA2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms