Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SrrtQ99MR6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SrrtQ99MR6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms