Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkd1Q99MH6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nkd1Q99MH6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms