Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pacsin3Q99JB8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Pacsin3Q99JB8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms