Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ddb2Q99J79 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddb2Q99J79 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ddb2Q99J79 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms