Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Def8Q99J78 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Def8Q99J78 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms