Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sf3b5Q923D4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sf3b5Q923D4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 268.1 ms