Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sf3b3Q921M3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sf3b3Q921M3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms