Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ8

Pcdhb22, Protocadherin beta 22, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb22Q91XZ8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdhb22Q91XZ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdhb22Q91XZ8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdhb22Q91XZ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms