Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Setd3Q91WC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Setd3Q91WC0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms