Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc8Q8VD72 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc8Q8VD72 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms