Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc58Q8R3Q6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc58Q8R3Q6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms