Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdk5rap2Q8K389 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cdk5rap2Q8K389 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cdk5rap2Q8K389 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms