Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Lrrtm1Q8K377 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lrrtm1Q8K377 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms