Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lmbrd1Q8K0B2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lmbrd1Q8K0B2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms