Protein–RNA interactions for Protein: Q8CID3

Fam20a, Pseudokinase FAM20A, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20aQ8CID3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fam20aQ8CID3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam20aQ8CID3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam20aQ8CID3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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