Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nav1Q8CH77 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nav1Q8CH77 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms