Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tshz3Q8CGV9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tshz3Q8CGV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tshz3Q8CGV9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms