Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1F4

Csgalnact2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csgalnact2Q8C1F4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csgalnact2Q8C1F4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csgalnact2Q8C1F4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csgalnact2Q8C1F4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csgalnact2Q8C1F4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csgalnact2Q8C1F4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Csgalnact2Q8C1F4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Csgalnact2Q8C1F4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csgalnact2Q8C1F4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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