Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q9

Rapgef5, Rap guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

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Length 814 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef5Q8C0Q9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Rapgef5Q8C0Q9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rapgef5Q8C0Q9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Rapgef5Q8C0Q9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rapgef5Q8C0Q9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef5Q8C0Q9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Rapgef5Q8C0Q9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Rapgef5Q8C0Q9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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