Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Strip1Q8C079 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Strip1Q8C079 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms