Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cldn17Q8BXA6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cldn17Q8BXA6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cldn17Q8BXA6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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