Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ube3dQ8BX13 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ube3dQ8BX13 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ube3dQ8BX13 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms