Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TtpaQ8BWP5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms