Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Triml1Q8BVP1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Triml1Q8BVP1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms