Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep55Q8BT07 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep55Q8BT07 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep55Q8BT07 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms