Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Gga3Q8BMI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gga3Q8BMI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gga3Q8BMI3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms