Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyp4f39Q8BGU0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cyp4f39Q8BGU0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cyp4f39Q8BGU0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms