Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGP6

Slc25a40, Solute carrier family 25 member 40, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc25a40Q8BGP6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc25a40Q8BGP6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc25a40Q8BGP6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc25a40Q8BGP6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms