Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG73

Sh3bgrl2, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 2, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl2Q8BG73 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sh3bgrl2Q8BG73 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh3bgrl2Q8BG73 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms