Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pcsk9Q80W65 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Pcsk9Q80W65 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pcsk9Q80W65 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pcsk9Q80W65 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms