Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc155Q80VJ8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms