Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQH8

Nup188, Nucleoporin NUP188 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup188Q6ZQH8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nup188Q6ZQH8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nup188Q6ZQH8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nup188Q6ZQH8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms