Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Slc44a1Q6X893 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc44a1Q6X893 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc44a1Q6X893 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms